一、相關法律規定：
- 勞基法第22條第2項：工資應全額直接給付勞工。
- 勞基法第26條：雇主不得預扣勞工工資作為違約金或賠償費用。
- 勞基法第79條第1項第1款及第80條之1：違反工資全額給付原則的罰則。
二、法院見解：
根據最高行政法院112年度上字第411號判決，雇主應將工資全額給付予勞工，且不得預扣工資作為違約金。若雙方對違約事由、金額有爭議，應透過行政調解或司法途徑解決。
三、實務建議：
- 保持溝通紀錄：在招聘過程中，應保留重要條件的書面紀錄。
- 協商處理違約金：與員工協商違約金多寡，或透過行政調解或司法途徑解決。
- 避免逕自扣薪：不顧勞工反對扣除違約金，將違反工資全額給付原則，可能受罰。
公司在處理員工離職時，應遵守勞動基準法的規定，確保工資全額給付，避免因預扣工資而違法受罰。正確的處理方式是與員工協商違約金，或透過行政調解或司法途徑解決。